Yeni Nesil Dizileme (NGS)

Yeni Nesil Dizileme (NGS), çok yönlü ve kapsamlı analiz ile kanser genomlarında daha fazla mutasyona uğrama
eğiliminde olan genlerdeki mutasyonların hızlı bir şekilde incelenmesine ve ayrıntılı olarak belirlenmesine olanak sağlar.

NGS ile belirlenen mutasyon sayısının diğer dizileme yöntemlerine kıyasla daha fazla olduğu kanıtlanmıştır.
Böylelikle NGS ile uygun tedavi seçeneklerinin belirlenme oranı daha fazladır. Caris Molecular Intelligence, NGS kanser paneli kullanarak mutasyon analizi yapar.’’

MI Profile™
Immünohistokimya (IHC) Kromojenik in situ
Hibridizasyon (CISH)
Floresan in situ
Hibridizasyon (FISH)1
Yeni Nesil Dizileme Fragment Analizi Piro
Dizileme
ALK (sadece NSCLC), AR, ER, ERCC1, HER2, MGMT2, MLH12,
MSH22, MSH62, PD-L1, PMS22, PR, PTEN, RRM1,
TLE3 (sadece meme kanseri), TOP2A, TOPO1, TS, TUBB3
cMET (sadece NSCLC),
EGFR (sadece NSCLC),
HER2, TOP2A (sadece meme kanseri)
1p19q (sadece gliom,)
ROS1 (sadece NSCLC)
MI Profile™ Genişletilmiş Yeni Nesil Dizileme EGFRvIII
(sadece gliom)
MSI2
MGMT Metilasyon
Analizi
(sadece gliom)
Nokta Mutasyonlar ve Indels
ABI1 BRD4 CRLF2 FOXO4 HOXC11 KLF4 MUC1 PAK3 RHOH TAL2
ABL1 BTG1 DDB2 FSTL3 HOXC13 KLK2 MUTYH PATZ1 RNF213 TBL1XR1
ACKR3 BTK DDIT3 GATA1 HOXD11 LASP1 MYCL (MYCL1) PAX8 RPL10 TCEA1
AKT1 C15orf65 DNM2 GATA2 HOXD13 LMO1 NBN PDE4DIP SEPT5 TCL1A
AMER1 (FAM123B) CBLC DNMT3A GNA11 HRAS LMO2 NDRG1 PHF6 SEPT6 TERT
AR CD79B EIF4A2 GPC3 IKBKE MAFB NKX2-1 PHOX2B SFPQ TFE3
ARAF CDH1 ELF4 HEY1 INHBA MAX NONO PIK3CG SLC45A3 TFPT
ATP2B3 CDK12 ELN HIST1H3B IRS2 MECOM NOTCH1 PLAG1 SMARCA4 THRAP3
ATRX CDKN2B ERCC1 HIST1H4I JUN MED12 NRAS PMS1 SOCS1 TLX3
BCL11B CDKN2C ETV4 HLF KAT6A (MYST3) MKL1 NUMA1 POU5F1 SOX2 TMPRSS2
BCL2 CEBPA FAM46C HMGN2P46 KAT6B MLLT11 NUTM2B PPP2R1A SPOP UBR5
BCL2L2 CHCHD7 FANCF HNF1A KCNJ5 MN1 OLIG2 PRF1 SRC VHL
BCOR CNOT3 FEV HOXA11 KDM5C MPL OMD PRKDC SSX1 WAS
BCORL1 COL1A1 FOXL2 HOXA13 KDM6A MSN P2RY8 RAD21 STAG2 ZBTB16
BRD3 COX6C FOXO3 HOXA9 KDSR MTCP1 PAFAH1B2 RECQL4 TAL1 ZRSR2
Nokta Mutasyonlar, Indels ve Kopya Sayısı Varyantları
ABL2 BRCA2 COPB1 ESR1 FUS KIT MYB PER1 RUNX1 TFG
ACSL3 BRIP1 CREB1 ETV1 GAS7 KLHL6 MYC PICALM RUNX1T1 TFRC
ACSL6 BUB1B CREB3L1 ETV5 GATA3 KMT2A (MLL) MYCN PIK3CA SBDS TGFBR2
AFF1 C11orf30 (EMSY) CREB3L2 ETV6 GID4 (C17orf39) KMT2C (MLL3) MYD88 PIK3R1 SDC4 TLX1
AFF3 C2orf44 CREBBP EWSR1 GMPS KMT2D (MLL2) MYH11 PIK3R2 SDHAF2 TNFAIP3
AFF4 CACNA1D CRKL EXT1 GNA13 KRAS MYH9 PIM1 SDHB TNFRSF14
AKAP9 CALR CRTC1 EXT2 GNAQ KTN1 NACA PML SDHC TNFRSF17
AKT2 CAMTA1 CRTC3 EZH2 GNAS LCK NCKIPSD PMS2 SDHD TOP1
AKT3 CANT1 CSF1R EZR GOLGA5 LCP1 NCOA1 POLE SEPT9 TP53
ALDH2 CARD11 CSF3R FANCA GOPC LGR5 NCOA2 POT1 SET TPM3
ALK CARS CTCF FANCC GPHN LHFP NCOA4 POU2AF1 SETBP1 TPM4
APC CASC5 CTLA4 FANCD2 GPR124 LIFR NF1 PPARG SETD2 TPR
ARFRP1 CASP8 CTNNA1 FANCE GRIN2A LPP NF2 PRCC SF3B1 TRAF7
ARHGAP26 CBFA2T3 CTNNB1 FANCG GSK3B LRIG3 NFE2L2 PRDM1 SH2B3 TRIM26
ARHGEF12 CBFB CYLD FANCL H3F3A LRP1B NFIB PRDM16 SH3GL1 TRIM27
ARID1A CBL CYP2D6 FAS H3F3B LYL1 NFKB2 PRKAR1A SLC34A2 TRIM33
ARID2 CBLB DAXX FBXO11 HERPUD1 MAF NFKBIA PRRX1 SMAD2 TRIP11
ARNT CCDC6 DDR2 FBXW7 HGF MALT1 NIN PSIP1 SMAD4 TRRAP
ASPSCR1 CCNB1IP1 DDX10 FCRL4 HIP1 MAML2 NOTCH2 PTCH1 SMARCB1 TSC1
ASXL1 CCND1 DDX5 FGF10 HMGA1 MAP2K1 NPM1 PTEN SMARCE1 TSC2
ATF1 CCND2 DDX6 FGF14 HMGA2 MAP2K2 NR4A3 PTPN11 SMO TSHR
ATIC CCND3 DEK FGF19 HNRNPA2B1 MAP2K4 NSD1 PTPRC SNX29 TTL
ATM CCNE1 DICER1 FGF23 HOOK3 MAP3K1 NT5C2 RABEP1 SOX10 U2AF1
ATP1A1 CD274 (PDL1) DOT1L FGF3 HSP90AA1 MCL1 NTRK1 RAC1 SPECC1 USP6
ATR CD74 EBF1 FGF4 HSP90AB1 MDM2 NTRK2 RAD50 SPEN VEGFA
AURKA CD79A ECT2L FGF6 IDH1 MDM4 NTRK3 RAD51 SRGAP3 VEGFB
AURKB CDC73 EGFR FGFR1 IDH2 MDS2 NUP214 RAD51B SRSF2 VTI1A
AXIN1
AXIN1 CDH11 ELK4 FGFR1OP IGF1R MEF2B NUP93 RAF1 SRSF3 WHSC1
AXL CDK4 ELL FGFR2 IKZF1 MEN1 NUP98 RALGDS SS18 WHSC1L1
BAP1 CDK6 EML4 FGFR3 IL2 MET (cMET) NUTM1 RANBP17 SS18L1 WIF1
BARD1 CDK8 EP300 FGFR4 IL21R MITF PALB2 RAP1GDS1 STAT3 WISP3
BCL10 CDKN1B EPHA3 FH IL6ST MLF1 PAX3 RARA STAT4 WRN
BCL11A CDKN2A EPHA5 FHIT IL7R MLH1 PAX5 RB1 STAT5B WT1
BCL2L11 CDX2 EPHB1 FIP1L1 IRF4 MLLT1 PAX7 RBM15 STIL WWTR1
BCL3 CHEK1 EPS15 FLCN ITK MLLT10 PBRM1 REL STK11 XPA
BCL6 CHEK2 ERBB2 (HER2) FLI1 JAK1 MLLT3 PBX1 RET SUFU XPC
BCL7A CHIC2 ERBB3 (HER3) FLT1 JAK2 MLLT4 PCM1 RICTOR SUZ12 XPO1
BCL9
BCL9 CHN1 ERBB4 (HER4) FLT3 JAK3 MLLT6 PCSK7 RMI2 SYK YWHAE
BCR CIC ERC1 FLT4 JAZF1 MNX1 PDCD1 (PD1) RNF43 TAF15 ZMYM2
BIRC3 CIITA ERCC2 FNBP1 KDM5A MRE11A PDCD1LG2 (PDL2) ROS1 TCF12 ZNF217
BLM CLP1 ERCC3 FOXA1 KDR (VEGFR2) MSH2 PDGFB RPL22 TCF3 ZNF331
BMPR1A CLTC ERCC4 FOXO1 KEAP1 MSH6 PDGFRA RPL5 TCF7L2 ZNF384
BRAF CLTCL1 ERCC5 FOXP1 KIAA1549 MSI2 PDGFRB RPN1 TET1 ZNF521
BRCA1 CNBP ERG FUBP1 IF5B MTOR PDK1 RPTOR TET2 ZNF703
CNTRL TFEB